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Contenu de l'offre Data scientist/informaticien(ne)- Recherche biomédicale— H/F chez Centre Antoine-Lacassagne
référence de l’annonce (DEBDS/DATA -2021)
Le Département d’Epidémiologie, de Biostatistique et des Données de Santé (DEBDS) du CAL est composé d’une équipe de data-manageur qui sont garants de la qualité, de la fiabilité, de la sécurité et de la conservation des données et d’une équipe de méthodologistes/biostatisticiens qui assurent le choix et la conception du design des études, les analyses statistiques et l’aide à la publication scientifique.
Chaque membre du DEBDS apporte son expertise lors de la conception des études biomédicales, de la gestion des données en accord avec les exigences règlementaires, de la réalisation des analyses statistiques, de l’exploitation des résultats et de l’aide à la publication.
Depuis 2021, la direction du CAL a missionné le DEBDS à la création d’une plateforme de données de santé (PDS). L’objectif est de centraliser les données structurées disponible au CAL, mais égalementde collecter automatiquement les données non structurées par des technologie d’intelligence artificielle.
Votre mission
Participer à la mise en place de la PDS et gérer les différents flux de données et leurs intégrations, sous la supervision du responsable de l’unité de data management, tout en installant les différents logiciels et solutions informatiques, en partenariat avec la Direction des Systèmes Informatiques (DSI) du CAL :
Participer à la définition du Common Data Model
Installer en collaboration avec la DSI le logiciel pour structurer la PDS (i2B2 ou OHDSI-OMOP)
Gérer les différents flux de données structurées (chimiothérapies, radiothérapies, hospitalisations etc…) et les intégrer dynamiquement dans la PDS
Participer au développement et à l’amélioration de techniques innovantes d’intelligence artificielle de structurations automatiques des données non structurées
Développer et mettre en place des solutions logicielles pour répondre aux besoins de la communauté médicale
Contrat à durée déterminée de 12 mois à temps plein, avec possibilité d’évolution en contrat à durée indéterminée.
Compétences
Compétences dans la gestion de big data
Connaissances des références d’organisation de données (HL7, OSIRIS, OHDSI-OMOP, CIM10, CDISC)
Maîtrise SQL
Maitrise Python
Très bonnes connaissances des méthodes de machine et deep learning
Solides connaissances dans les systèmes d’information
Connaissances de logiciels de bases de données (Oracle, MySQL, SyBase, SQL Server)
Une connaissance de RedCAP serait un plus
Une maitrise de i2b2 serait un plus
Qualité d’organisation, analytique, de synthèse, rédactionnelle.
Autonomie, esprit d’initiative, réactivité et qualités relationnelles
Vous devez avoir un bon niveau d’anglais scientifique (oral et écrit).
Une Connaissance du secteur médical serait un plus
Relations
Hiérarchie: Directeur du DEBDS, Cadre Data Manager.
Relations internes : Statisticiens, Data manager,
Relations externes : Informaticiens, investigateurs coordonnateurs, promoteur des essais, autres partenaires de la recherche, chef de projet, ARC, DPO.
Type de contrat
Basé à Nice, en présentiel.
Contrat à durée déterminée de 12 mois à temps plein, avec possibilité d’évolution en contrat à durée indéterminée.
Centre Antoine-Lacassagne
Fondé en 1961 et situé à Nice, le Centre Antoine Lacassagne est un des 18 Centres de Lutte Contre le Cancer français, membre du Groupe UNICANCER.
Etablissement de santé de droit privé à but non lucratif et reconnu d’utilité publique (statut ESPIC - Etablissement de Santé Privé d’Intérêt Collectif), le Centre Antoine Lacassagne remplit des missions de service public en cancérologie :
Soins : prévention, dépistage, traitement et réinsertion
Recherche : fondamentale, translationnelle, clinique
Enseignement : universitaire et post-universitaire.
Avec 197 lits et places et 843 salariés, le Centre Antoine Lacassagne prend en charge tous les types de cancer et traite une file active de plus de 6000 patients par an. Institut de référence en cancérologie, il a pour ambition de faire bénéficier à tous les patients des innovations qui vont révolutionner la médecine de demain : médecine personnalisée, immunothérapie, protonthérapie…, tout en garantissant un haut niveau de qualité de prise en charge.
http://www.centreantoinelacassagne.org/
Nice
Master 2 ou thèse dans le domaine de la data science ou équivalent
Aucune expérience, Débutant (moins de 2 ans), Expérimenté (2 à 5 ans), Confirmé (5 ans et plus)
CDD / Remplacement
Ingénieur informatique