Data Scientist - Instrumentation

Contenu de l'offre Data Scientist - Instrumentation chez Depixus SAS

Au sein d'une jeune société de biotechnologie en pleine croissance, qui compte actuellement une quarantaine de personnes basées principalement à Paris et à Cambridge (Royaume-Uni), vous rejoindrez notre organisation multidisciplinaire, travaillant au développement de notre technologie innovante pour l'extraction rapide, précise et peu coûteuse d'informations génétiques et épigénétiques à partir de molécules uniques d'ADN et d'ARN. Depixus entrant dans sa phase commerciale, nous avons besoin d'une ou d'un data scientist - instrumentation pour nous aider à développer des analyses permettant de débloquer davantage d'informations à partir des données générées par nos instruments. Ce poste conviendrait aux candidats ayant une solide expérience en instrumentation, y compris une bonne connaissance de l'analyse des signaux, des statistiques et de l'analyse des données, ainsi que de la programmation.

Working within a young and fast-growing biotechnology company, currently around 40 people based mainly in Paris and in Cambridge UK, you will be joining our multidiscipline organisation, working on the development of our innovative technology for the fast, accurate, and inexpensive extraction of genetic and epigenetic information from single molecules of DNA and RNA. Depixus is entering the commercial phase, we require an Instrumentation Data Scientist to help develop analyses that further unlocks information from data generated by our instruments. This role would suit candidates that have a solid background in instrumentation, including good knowledge in signal analysis, statistics, and data analysis as well as programming.

Site web :

http://depixus.com/

Poste et missions

Description du poste

Nous sommes à la recherche d'une personne exceptionnelle qui aime travailler dans un environnement au rythme rapide et faire partie d'une équipe multidisciplinaire hautement collaborative. En étroite collaboration avec les équipes de biologie et d'instrumentation, vous devrez explorer les signaux provenant de nos instruments, puis créer des processus automatisés pour extraire et présenter des données biologiquement significatives aux utilisateurs biologistes. En collaboration avec des partenaires universitaires et OEM, vous travaillerez à l'agrégation de ces données dans des outils de R&D et de diagnostic de nouvelle génération.

Il s'agit d'une excellente occasion de jouer un rôle important dans le développement d'une technologie de pointe.

Principales responsabilités

Participer à l'analyse des données et au développement de la bioinformatique, notamment : L'élaboration et la mise en œuvre d'outils d'analyse du signal pour le traitement initial des données brutes générées par nos systèmes instrumentaux. Élaboration d'algorithmes de modélisation et d'exploration de données en aval pour l'analyse des cartes, des séquences et des empreintes épigénétiques de l'ARN et de l'ADN. Développement de tests automatisés pour assurer la qualité du traitement des données et des algorithmes bioinformatiques. Participation à des revues formelles et informelles de conception et de code. Participation à des réunions de groupe, présentation du travail aux membres du groupe.

Job description

We are seeking an exceptional individual who enjoys working in a fast-paced environment and being part of a highly collaborative and multidiscipline team. Working closely with Biology and Instrumentation teams, you will need to explore the signals coming from our instruments, then create automated processes for extracting and presenting biologically significant data to biologist users. In partnership with academic and OEM partners, you will work at further aggregating this data into next generation R&D and diagnosis tools.

This is a great opportunity to play an important role in the development of a cutting-edge technology.

Key responsibilities

Participate in data analytics and bioinformatics development, including: Elaboration and implementation of signal analysis tools for initial treatment of the raw data generated by our instrument systems. Elaboration of downstream data mining and modelling algorithms for analysis of RNA and DNA maps, sequences, and epigenetic fingerprints. Development of automated tests to ensure the quality of data processing and bioinformatic algorithms. Participation in formal and informal design and code reviews. Participation in group meetings, presentation of work to group members

Mobilité géographique :

Pas de déplacement

Profil

Qualifications et expérience essentielles

Diplôme de niveau supérieur dans le domaine de l'instrumentation, de l'analyse de données ou dans des domaines connexes, niveau Master ou plus. Bonne connaissance des méthodes d'analyse des données et des signaux. Bonne connaissance des statistiques, idéalement avec une expérience préalable du traitement statistique des ensembles de données biologiques. Connaissance pratique de la programmation, soit Python, Julia ou C++. Volonté d'apprendre et de travailler dans l'un de ces langages. Bonnes capacités de communication en anglais oral. Les candidats doivent être capables de présenter des informations et des données techniques à des non-experts de manière claire et concise.

Qualifications et expérience souhaitables

Expérience en bioinformatique. Maîtrise de Python ou Julia. Expérience de travail dans le domaine du calcul haute performance et des bases de données relationnelles. Expérience dans le développement de logiciels

Essential qualifications & experience

Graduate-level degree in the field of instrumentation, data analysis or related fields, ideally at masters’ level or above. Good knowledge of data analysis and signal analysis methods. Good knowledge of statistics, ideally with previous experience of statistical treatment of biological datasets. Working knowledge of programming, either Python, Julia or C++. Willingness to learn and work in any of these languages. Good communication skills in oral English. Candidates should be capable of presenting technical information and data to non-experts in a clear and concise manner.

Desirable qualifications & Experience

Experience in bioinformatics. Proficiency in Python or Julia. Experience working in High Performance Computing and relational databases. Experience in software development