Data Manager F/H

Contenu de l'offre Data Manager F/H chez LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER

Rattaché au Directeur Scientifique du programme CIT, les missions du Data Manager s’articulent autour de 2 axes :

Missions Data Management :
Maintenir la qualité et les mises à jour de la base de données multi-cancers interne au programme, en prenant en compte la traçabilité des échantillons à travers tout le processus, et selon toutes les technologies.

Réceptionner les données omiques en s’assurant de leur complétude et de leur qualité.

Organiser le traitement et le contrôle qualité des données omiques.

Assurer une démarche open-data pour garantir la publication des données CIT et l’intégration de données externes.

Maintenir une organisation optimale du stockage et de la collecte des données.

Missions Système d’Information :
Veiller à la mise en place et au maintien de solutions matérielles et logicielles fiables et efficaces pour le stockage et la sauvegarde des données.

Participer aux échanges avec la Délégation des Systèmes d’Information (DSI) dans le cadre d’une évolution ou d’un changement de la plateforme informatique CIT.
Profil recherché Titulaire d’un Bac+5, Master2 Informatique/Bioinformatique avec une expérience réussie dans le data management en recherche biomédicale (3 ans au minimum) et une très bonne connaissance des architectures informatiques.

Compétences requises :
Terminologie des cancers

, procédures opératoires de data management et règlementation CNIL.

Base de données relationnelles type mariadb, Mysql ou autre.

Langage SQL, Excel avancé, XML et langage R.

Architecture system, shell linux.

Maîtrise de l’anglais technique.

La connaissance des plateformes d’intégration de données RedCap et/ou Transmart serait un plus.

Aptitudes nécessaires :
sens de l’organisation et du relationnel, autonomie, rigueur.

Comme tous les postes de l’Association, ce poste est ouvert aux personnes en situation de handicap.
Entreprise La ligue Nationale Contre le Cancer finance et pilote un programme national de

génomique des cancers

appelé « Cartes d’Identité des Tumeurs® » (CIT). Ce programme vise à caractériser un grand nombre de tumeurs au niveau moléculaire, dans un double objectif cognitif et clinique, avec pour perspective une prise en charge thérapeutique mieux ciblée des patients.

Les données moléculaires issues d’analyses sur puces ou de séquençage haut débit d’ADN et d’ARN, sont intégrées dans un système d’information interne à CIT, ainsi que toutes les annotations concernant les échantillons de tumeurs analysées.

Dans ce contexte, les données utilisées par le programme CIT sont hétérogènes, couteuses et d’une grande volumétrie, nécessitant la mise en place et le maintien d’une plateforme informatique de grande performance pour le calcul et le stockage.