Ingénieur-e en Intégration de données/ Data Scientist

Contenu de l'offre Ingénieur-e en Intégration de données/ Data Scientist chez Inserm

L’ingénieur sera en charge de l’analyse des données générées par l’équipe de Michel
AURRAND-LIONS et par les différentes équipes travaillant sur les cohortes de leucémies
aigües myéloïdes collectées dans le cadre d’essais cliniques conduit à l’IPC. Les données
consisteront en des variables discrètes ou continues refletant l’expression génique
(RNAseq et Nanostring), des fréquences de cellules mesurées par cytométrie en flux, des
altérations moléculaires et les données biologiques associées à la LAM.

Activités  Traiter et Analyser les données pour définir des prédicteurs pronostiques ou de répoinse
principales aux traitements. 

Utiliser et comparer les différentes méthodes de modélisation (LASSO, Random forest,
CNN, ..) 

Utiliser les outils biostatistiques

Activités  Assurer une veille technologique, développement et maintenance des workflows de
associées bioinformatique. 

Rédiger des sections spécialisées des articles.

Connaissances  Connaissance opérationnelle des techniques de programmation : R/Bioconductor, SAS 
Connaissance opérationnelle des systèmes de type versionage de code (GitLab) 
Connaissance en biologie permettant de comprendre les questions posées

Savoir-faire  Utiliser un ensemble cohérent d’outils mathématiques, statistiques et informatiques,
adaptés au traitement des données. 

Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse 
Maîtrise de l'anglais scientifique à l’oral et à l’écrit

Aptitudes  Autonomie 
Capacité d'innovation et de veille technologique 
Communication, esprit d’équipe, capacité à échanger avec des cliniciens et biologistes 
Capacités organisationnelles, présentation synthétique et didactique des résultats

scientifiques.

Spécificité(s) / La personne recrutée sera amenée à interagir régulièrement avec les membres de l’équipe de
Contrainte(s) biologie, les cliniciens, les biostatisticiens et la plate-forme de bioinformatique du CRCM
du poste

Expérience  Une première expérience réussie en analyses bioinformatiques et modélisation de
souhaitée données cliniques et d’expression génique

Diplôme(s)
souhaité(s)  Master 1 ou équivalent

Institut national de la santé et de la recherche médicale

Structure d’accueil

Code unité U1068

Intitulé CRCM-Equipe Interactions leuco/Stromales dans l’hématopoïèse normal et pathologique

Responsable Michel Aurrand-Lions

Composition Le CRCM accueille plus de 300 personnes regroupées en 18 équipes autonomes

Adresse 27 boulevard Leï Roure 13009 Marseille

Délégation
Régionale Provence Alpes Côte d’Azur et Corse

Contrat

Type CDD

Durée 6 mois

Rémunération Selon ancienneté

Date souhaitée de er
prise de fonctions 1 Novembre 2022

Pour postuler
Envoyer votre candidature (lettre de motivation et CV) à michel.aurrand-lions@inserm.fr

Institut national de la santé et de la recherche médicale 2